Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT5P48643 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT5P48643 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT5P48643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT5P48643 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT5P48643 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT5P48643 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT5P48643 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT5P48643 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCT5P48643 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT5P48643 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT5P48643 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT5P48643 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT5P48643 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT5P48643 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT5P48643 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT5P48643 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT5P48643 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT5P48643 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT5P48643 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT5P48643 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT5P48643 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT5P48643 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCT5P48643 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT5P48643 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT5P48643 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT5P48643 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT5P48643 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT5P48643 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT5P48643 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT5P48643 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT5P48643 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT5P48643 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCT5P48643 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCT5P48643 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCT5P48643 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCT5P48643 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCT5P48643 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT5P48643 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT5P48643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT5P48643 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT5P48643 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT5P48643 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT5P48643 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT5P48643 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT5P48643 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT5P48643 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT5P48643 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT5P48643 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT5P48643 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT5P48643 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT5P48643 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCT5P48643 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT5P48643 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT5P48643 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT5P48643 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT5P48643 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT5P48643 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT5P48643 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT5P48643 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT5P48643 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT5P48643 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT5P48643 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT5P48643 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT5P48643 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT5P48643 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT5P48643 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT5P48643 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT5P48643 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT5P48643 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT5P48643 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT5P48643 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT5P48643 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT5P48643 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT5P48643 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT5P48643 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT5P48643 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT5P48643 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCT5P48643 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT5P48643 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT5P48643 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT5P48643 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT5P48643 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT5P48643 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT5P48643 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT5P48643 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT5P48643 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT5P48643 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT5P48643 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT5P48643 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT5P48643 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT5P48643 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT5P48643 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT5P48643 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT5P48643 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT5P48643 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT5P48643 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT5P48643 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT5P48643 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT5P48643 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms