Protein–RNA interactions for Protein: P48594

SERPINB4, Serpin B4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB4P48594 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINB4P48594 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINB4P48594 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB4P48594 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINB4P48594 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINB4P48594 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms