Protein–RNA interactions for Protein: P47993

Xcl1, Lymphotactin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xcl1P47993 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xcl1P47993 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xcl1P47993 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xcl1P47993 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms