Protein–RNA interactions for Protein: P47754

Capza2, F-actin-capping protein subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza2P47754 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza2P47754 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza2P47754 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza2P47754 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capza2P47754 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza2P47754 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capza2P47754 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza2P47754 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza2P47754 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza2P47754 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza2P47754 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza2P47754 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza2P47754 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Capza2P47754 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Capza2P47754 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza2P47754 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capza2P47754 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza2P47754 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza2P47754 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza2P47754 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza2P47754 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Capza2P47754 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza2P47754 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza2P47754 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza2P47754 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza2P47754 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza2P47754 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza2P47754 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Capza2P47754 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza2P47754 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capza2P47754 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capza2P47754 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capza2P47754 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capza2P47754 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms