Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL28P46779 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL28P46779 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL28P46779 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL28P46779 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL28P46779 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL28P46779 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL28P46779 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL28P46779 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL28P46779 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL28P46779 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL28P46779 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL28P46779 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL28P46779 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL28P46779 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL28P46779 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL28P46779 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL28P46779 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL28P46779 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL28P46779 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL28P46779 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL28P46779 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL28P46779 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL28P46779 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL28P46779 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL28P46779 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL28P46779 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL28P46779 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL28P46779 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL28P46779 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL28P46779 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL28P46779 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL28P46779 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL28P46779 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL28P46779 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL28P46779 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL28P46779 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL28P46779 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL28P46779 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL28P46779 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL28P46779 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL28P46779 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL28P46779 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL28P46779 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL28P46779 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL28P46779 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL28P46779 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL28P46779 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL28P46779 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL28P46779 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL28P46779 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL28P46779 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL28P46779 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL28P46779 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL28P46779 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL28P46779 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL28P46779 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL28P46779 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL28P46779 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL28P46779 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL28P46779 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL28P46779 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL28P46779 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL28P46779 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL28P46779 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL28P46779 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL28P46779 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL28P46779 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL28P46779 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL28P46779 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL28P46779 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL28P46779 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL28P46779 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL28P46779 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL28P46779 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL28P46779 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL28P46779 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL28P46779 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL28P46779 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL28P46779 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL28P46779 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL28P46779 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms