Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL21P46778 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL21P46778 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL21P46778 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL21P46778 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL21P46778 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL21P46778 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL21P46778 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL21P46778 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL21P46778 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL21P46778 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL21P46778 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL21P46778 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL21P46778 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPL21P46778 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL21P46778 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL21P46778 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL21P46778 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL21P46778 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL21P46778 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL21P46778 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL21P46778 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL21P46778 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL21P46778 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL21P46778 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL21P46778 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL21P46778 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL21P46778 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL21P46778 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL21P46778 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL21P46778 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPL21P46778 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RPL21P46778 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL21P46778 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL21P46778 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL21P46778 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL21P46778 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL21P46778 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL21P46778 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL21P46778 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL21P46778 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL21P46778 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL21P46778 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL21P46778 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL21P46778 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL21P46778 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL21P46778 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL21P46778 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL21P46778 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL21P46778 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL21P46778 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL21P46778 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL21P46778 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL21P46778 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL21P46778 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL21P46778 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL21P46778 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL21P46778 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL21P46778 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL21P46778 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL21P46778 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL21P46778 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL21P46778 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL21P46778 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL21P46778 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL21P46778 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL21P46778 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL21P46778 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL21P46778 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL21P46778 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL21P46778 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL21P46778 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL21P46778 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL21P46778 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL21P46778 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL21P46778 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL21P46778 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL21P46778 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL21P46778 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL21P46778 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL21P46778 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL21P46778 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL21P46778 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL21P46778 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL21P46778 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL21P46778 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL21P46778 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL21P46778 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL21P46778 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL21P46778 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL21P46778 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL21P46778 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL21P46778 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL21P46778 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL21P46778 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL21P46778 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL21P46778 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL21P46778 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL21P46778 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL21P46778 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms