Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo1bP46735 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myo1bP46735 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo1bP46735 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo1bP46735 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Myo1bP46735 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo1bP46735 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms