Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4bP46467 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps4bP46467 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps4bP46467 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps4bP46467 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms