Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 34.6
MATR3P43243 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 34.6
MATR3P43243 EP400-209ENST00000616136 3134 ntTSL 214.27□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 34.6
MATR3P43243 EP400-201ENST00000330386 3908 ntTSL 213.27□□□□□ -0.294e-9■■■■■ 34.6
MATR3P43243 EP400-207ENST00000611739 4314 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.524e-9■■■■■ 34.6
MATR3P43243 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.218e-10■■■■■ 34.6
MATR3P43243 ZNF706-203ENST00000518071 540 ntTSL 44.53□□□□□ -1.688e-10■■■■■ 34.6
MATR3P43243 ZNRF2P2-201ENST00000426767 663 ntTSL 326.93■■□□□ 1.98e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 34.5
MATR3P43243 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 34.5
MATR3P43243 FGF13-206ENST00000448673 652 ntTSL 59.77□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 34.5
MATR3P43243 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 34.5
MATR3P43243 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 35.79□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 34.5
MATR3P43243 TRMT11-209ENST00000479748 2093 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 TRMT11-206ENST00000466316 729 ntTSL 54.18□□□□□ -1.743e-9■■■■■ 34.5
MATR3P43243 TRMT11-207ENST00000468097 1009 ntTSL 53.21□□□□□ -1.92e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 STK3-202ENST00000424861 2065 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 STK3-211ENST00000521649 574 ntTSL 411.52□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 STK3-204ENST00000518165 817 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 34.5
MATR3P43243 ARFGAP2-219ENST00000529439 556 ntTSL 520.03■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 34.5
MATR3P43243 ARFGAP2-204ENST00000524727 995 ntTSL 217.14■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 34.5
MATR3P43243 ARFGAP2-222ENST00000530596 534 ntTSL 316.51■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 34.5
MATR3P43243 ARFGAP2-215ENST00000528041 578 ntTSL 411.17□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 34.5
MATR3P43243 ARFGAP2-221ENST00000529599 555 ntTSL 410.28□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 34.5
MATR3P43243 ARFGAP2-228ENST00000533939 577 ntTSL 39.65□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 34.5
MATR3P43243 TCF20-204ENST00000515426 633 ntTSL 518.7■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 34.3
MATR3P43243 LRMDA-211ENST00000595936 353 ntTSL 312.64□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 34.3
MATR3P43243 LRMDA-205ENST00000488759 337 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 34.3
MATR3P43243 LRMDA-203ENST00000483375 294 ntTSL 27.61□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 34.3
MATR3P43243 LRMDA-206ENST00000493194 246 ntTSL 25.06□□□□□ -1.61e-10■■■■■ 34.3
MATR3P43243 LRMDA-213ENST00000597823 606 ntTSL 44.84□□□□□ -1.631e-10■■■■■ 34.3
MATR3P43243 LRMDA-212ENST00000596228 563 ntTSL 43.6□□□□□ -1.831e-10■■■■■ 34.3
MATR3P43243 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 34.2
MATR3P43243 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 34.2
MATR3P43243 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 34.2
MATR3P43243 WDR70-206ENST00000510699 690 ntTSL 54.59□□□□□ -1.672e-9■■■■■ 34.2
MATR3P43243 ALCAM-204ENST00000470756 1770 ntTSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-215ENST00000583771 436 ntTSL 525.14■■□□□ 1.624e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-218ENST00000584453 1230 ntTSL 525.07■■□□□ 1.64e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-210ENST00000581332 451 ntTSL 423.12■■□□□ 1.294e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.14e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.764e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-206ENST00000578651 1177 ntTSL 219.42■□□□□ 0.74e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.524e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-222ENST00000585128 1296 ntTSL 514.21□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-208ENST00000580605 699 ntTSL 314.19□□□□□ -0.144e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 ENOSF1-221ENST00000585004 1501 ntTSL 210.83□□□□□ -0.684e-11■■■■■ 34.1
MATR3P43243 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.575e-9■■■■■ 34
MATR3P43243 DNAJC25-202ENST00000447096 2498 ntTSL 1 (best)23.94■■□□□ 1.425e-9■■■■■ 34
MATR3P43243 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.345e-9■■■■■ 34
MATR3P43243 DNAJC25-203ENST00000463589 2572 ntTSL 521.64■■□□□ 1.055e-9■■■■■ 34
MATR3P43243 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.844e-7■■■■■ 33.9
MATR3P43243 PSMG4-208ENST00000454610 2323 ntTSL 216.1■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 33.9
MATR3P43243 PSMG4-210ENST00000509933 2241 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 33.9
MATR3P43243 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.537e-10■■■■■ 33.8
MATR3P43243 ETNK1-203ENST00000538218 1659 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.497e-10■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 515.97■□□□□ 0.157e-10■■■■■ 33.8
MATR3P43243 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-10■■■■■ 33.8
MATR3P43243 ETNK1-205ENST00000544191 500 ntTSL 23.57□□□□□ -1.847e-10■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PRDM16-204ENST00000463591 384 ntTSL 522.29■■□□□ 1.162e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 MYH10-204ENST00000411957 732 ntTSL 319.06■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 C15orf38-AP3S2-203ENST00000559629 675 ntTSL 318.77■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 217.32■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 NFXL1-205ENST00000507131 2664 ntTSL 217.03■□□□□ 0.322e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 C15orf38-AP3S2-202ENST00000558648 664 ntTSL 514.65□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 NFXL1-203ENST00000464756 3865 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC14.03□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-213ENST00000617847 1649 ntTSL 513.6□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 NFXL1-206ENST00000507489 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 PRDM16-207ENST00000512462 3723 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-215ENST00000622090 580 ntTSL 513.47□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-205ENST00000610805 793 ntTSL 512.88□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 312.75□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AP3S2-202ENST00000423566 1262 ntTSL 212.47□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 212.43□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 AC093157.1-201ENST00000453011 794 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 33.8
MATR3P43243 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 33.8
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