Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DCCP43146 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
DCCP43146 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
DCCP43146 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DCCP43146 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DCCP43146 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DCCP43146 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DCCP43146 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DCCP43146 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
DCCP43146 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
DCCP43146 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCCP43146 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCCP43146 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCCP43146 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCCP43146 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
DCCP43146 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
DCCP43146 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCCP43146 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCCP43146 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCCP43146 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
DCCP43146 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
DCCP43146 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCCP43146 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCCP43146 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCCP43146 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCCP43146 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCCP43146 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCCP43146 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCCP43146 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCCP43146 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCCP43146 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCCP43146 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
DCCP43146 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCCP43146 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCCP43146 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCCP43146 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
DCCP43146 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCCP43146 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCCP43146 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCCP43146 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCCP43146 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCCP43146 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCCP43146 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCCP43146 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCCP43146 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCCP43146 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
DCCP43146 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DCCP43146 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DCCP43146 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DCCP43146 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DCCP43146 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCCP43146 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DCCP43146 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCCP43146 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DCCP43146 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DCCP43146 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCCP43146 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCCP43146 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DCCP43146 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
DCCP43146 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCCP43146 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCCP43146 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCCP43146 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
DCCP43146 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DCCP43146 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCCP43146 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DCCP43146 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCCP43146 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCCP43146 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
DCCP43146 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DCCP43146 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DCCP43146 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
DCCP43146 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
DCCP43146 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DCCP43146 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
DCCP43146 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DCCP43146 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DCCP43146 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DCCP43146 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCCP43146 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCCP43146 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
DCCP43146 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCCP43146 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCCP43146 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCCP43146 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCCP43146 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCCP43146 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
DCCP43146 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCCP43146 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCCP43146 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCCP43146 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCCP43146 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCCP43146 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCCP43146 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCCP43146 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
DCCP43146 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
DCCP43146 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCCP43146 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCCP43146 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCCP43146 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms