Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL5P42830 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL5P42830 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL5P42830 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL5P42830 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL5P42830 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CXCL5P42830 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL5P42830 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL5P42830 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL5P42830 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL5P42830 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms