Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KAP42356 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KAP42356 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PI4KAP42356 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4KAP42356 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4KAP42356 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms