Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTR1BP42025 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTR1BP42025 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTR1BP42025 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTR1BP42025 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms