Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELK3P41970 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELK3P41970 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELK3P41970 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELK3P41970 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ELK3P41970 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELK3P41970 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELK3P41970 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ELK3P41970 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELK3P41970 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ELK3P41970 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELK3P41970 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ELK3P41970 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELK3P41970 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELK3P41970 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELK3P41970 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ELK3P41970 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ELK3P41970 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ELK3P41970 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ELK3P41970 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ELK3P41970 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ELK3P41970 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ELK3P41970 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ELK3P41970 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ELK3P41970 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ELK3P41970 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ELK3P41970 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ELK3P41970 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ELK3P41970 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ELK3P41970 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ELK3P41970 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ELK3P41970 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ELK3P41970 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ELK3P41970 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ELK3P41970 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ELK3P41970 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ELK3P41970 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ELK3P41970 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ELK3P41970 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ELK3P41970 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ELK3P41970 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ELK3P41970 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ELK3P41970 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ELK3P41970 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ELK3P41970 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ELK3P41970 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ELK3P41970 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ELK3P41970 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ELK3P41970 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ELK3P41970 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ELK3P41970 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ELK3P41970 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ELK3P41970 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ELK3P41970 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ELK3P41970 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ELK3P41970 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ELK3P41970 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ELK3P41970 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ELK3P41970 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ELK3P41970 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ELK3P41970 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ELK3P41970 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ELK3P41970 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ELK3P41970 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ELK3P41970 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ELK3P41970 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ELK3P41970 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ELK3P41970 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ELK3P41970 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ELK3P41970 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ELK3P41970 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ELK3P41970 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ELK3P41970 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ELK3P41970 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELK3P41970 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELK3P41970 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELK3P41970 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ELK3P41970 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELK3P41970 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELK3P41970 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELK3P41970 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ELK3P41970 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ELK3P41970 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ELK3P41970 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELK3P41970 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELK3P41970 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms