Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC19A1P41440 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC19A1P41440 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC19A1P41440 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC19A1P41440 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms