Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTRLP40313 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTRLP40313 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTRLP40313 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTRLP40313 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTRLP40313 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTRLP40313 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTRLP40313 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTRLP40313 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTRLP40313 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTRLP40313 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTRLP40313 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTRLP40313 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTRLP40313 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTRLP40313 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTRLP40313 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTRLP40313 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTRLP40313 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTRLP40313 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTRLP40313 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTRLP40313 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTRLP40313 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTRLP40313 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTRLP40313 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTRLP40313 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTRLP40313 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTRLP40313 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTRLP40313 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTRLP40313 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTRLP40313 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTRLP40313 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTRLP40313 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTRLP40313 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTRLP40313 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTRLP40313 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTRLP40313 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTRLP40313 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTRLP40313 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTRLP40313 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTRLP40313 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTRLP40313 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTRLP40313 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTRLP40313 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTRLP40313 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTRLP40313 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTRLP40313 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTRLP40313 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTRLP40313 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTRLP40313 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTRLP40313 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTRLP40313 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTRLP40313 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTRLP40313 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTRLP40313 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTRLP40313 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTRLP40313 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTRLP40313 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTRLP40313 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTRLP40313 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTRLP40313 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTRLP40313 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTRLP40313 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTRLP40313 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTRLP40313 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTRLP40313 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTRLP40313 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTRLP40313 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTRLP40313 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTRLP40313 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTRLP40313 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTRLP40313 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTRLP40313 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTRLP40313 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTRLP40313 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTRLP40313 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTRLP40313 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTRLP40313 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTRLP40313 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTRLP40313 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTRLP40313 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTRLP40313 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTRLP40313 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTRLP40313 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTRLP40313 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTRLP40313 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTRLP40313 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTRLP40313 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTRLP40313 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTRLP40313 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTRLP40313 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms