Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PpargP37238 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpargP37238 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpargP37238 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PpargP37238 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpargP37238 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpargP37238 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpargP37238 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpargP37238 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpargP37238 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpargP37238 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PpargP37238 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpargP37238 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpargP37238 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpargP37238 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpargP37238 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PpargP37238 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpargP37238 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpargP37238 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpargP37238 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpargP37238 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PpargP37238 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PpargP37238 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PpargP37238 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PpargP37238 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PpargP37238 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PpargP37238 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PpargP37238 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PpargP37238 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PpargP37238 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpargP37238 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpargP37238 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpargP37238 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PpargP37238 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PpargP37238 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PpargP37238 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpargP37238 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpargP37238 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpargP37238 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpargP37238 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PpargP37238 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PpargP37238 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PpargP37238 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpargP37238 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpargP37238 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpargP37238 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpargP37238 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpargP37238 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PpargP37238 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PpargP37238 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PpargP37238 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PpargP37238 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PpargP37238 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpargP37238 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpargP37238 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpargP37238 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpargP37238 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpargP37238 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PpargP37238 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpargP37238 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpargP37238 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpargP37238 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpargP37238 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpargP37238 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpargP37238 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpargP37238 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpargP37238 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpargP37238 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpargP37238 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpargP37238 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpargP37238 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpargP37238 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpargP37238 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpargP37238 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpargP37238 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PpargP37238 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PpargP37238 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PpargP37238 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PpargP37238 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpargP37238 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpargP37238 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpargP37238 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PpargP37238 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PpargP37238 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PpargP37238 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PpargP37238 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PpargP37238 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PpargP37238 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpargP37238 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpargP37238 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpargP37238 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpargP37238 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpargP37238 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpargP37238 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpargP37238 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpargP37238 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpargP37238 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpargP37238 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpargP37238 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpargP37238 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 490.8 ms