Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA7P36544 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA7P36544 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA7P36544 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA7P36544 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms