Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1E1P36543 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1E1P36543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP6V1E1P36543 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1E1P36543 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms