Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT2P35908 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT2P35908 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT2P35908 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT2P35908 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT2P35908 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT2P35908 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT2P35908 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT2P35908 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT2P35908 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT2P35908 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT2P35908 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT2P35908 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT2P35908 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT2P35908 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT2P35908 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT2P35908 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT2P35908 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT2P35908 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT2P35908 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT2P35908 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT2P35908 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT2P35908 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT2P35908 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT2P35908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT2P35908 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT2P35908 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT2P35908 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT2P35908 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT2P35908 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT2P35908 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT2P35908 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT2P35908 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT2P35908 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT2P35908 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT2P35908 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT2P35908 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT2P35908 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT2P35908 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT2P35908 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT2P35908 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT2P35908 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT2P35908 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT2P35908 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT2P35908 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT2P35908 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT2P35908 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT2P35908 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT2P35908 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT2P35908 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT2P35908 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT2P35908 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT2P35908 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT2P35908 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT2P35908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KRT2P35908 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT2P35908 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT2P35908 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT2P35908 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT2P35908 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT2P35908 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT2P35908 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT2P35908 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT2P35908 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT2P35908 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT2P35908 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT2P35908 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT2P35908 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT2P35908 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT2P35908 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT2P35908 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT2P35908 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT2P35908 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT2P35908 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT2P35908 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT2P35908 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT2P35908 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT2P35908 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT2P35908 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT2P35908 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT2P35908 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT2P35908 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT2P35908 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT2P35908 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT2P35908 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT2P35908 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT2P35908 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT2P35908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT2P35908 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT2P35908 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT2P35908 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT2P35908 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT2P35908 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT2P35908 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT2P35908 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT2P35908 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT2P35908 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT2P35908 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT2P35908 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT2P35908 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms