Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sftpa1P35242 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sftpa1P35242 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sftpa1P35242 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sftpa1P35242 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sftpa1P35242 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sftpa1P35242 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms