Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCD1P33897 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCD1P33897 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCD1P33897 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCD1P33897 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCD1P33897 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms