Protein–RNA interactions for Protein: P32929

CTH, Cystathionine gamma-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHP32929 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTHP32929 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTHP32929 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTHP32929 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTHP32929 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTHP32929 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTHP32929 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTHP32929 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTHP32929 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTHP32929 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTHP32929 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTHP32929 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTHP32929 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTHP32929 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTHP32929 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTHP32929 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTHP32929 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTHP32929 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTHP32929 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTHP32929 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTHP32929 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTHP32929 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTHP32929 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTHP32929 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTHP32929 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTHP32929 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTHP32929 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTHP32929 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTHP32929 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTHP32929 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTHP32929 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTHP32929 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTHP32929 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTHP32929 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTHP32929 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTHP32929 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTHP32929 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTHP32929 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTHP32929 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTHP32929 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTHP32929 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTHP32929 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTHP32929 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTHP32929 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTHP32929 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTHP32929 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTHP32929 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTHP32929 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTHP32929 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTHP32929 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTHP32929 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTHP32929 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTHP32929 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTHP32929 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTHP32929 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTHP32929 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTHP32929 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTHP32929 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CTHP32929 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTHP32929 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTHP32929 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTHP32929 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTHP32929 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTHP32929 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTHP32929 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTHP32929 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTHP32929 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTHP32929 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTHP32929 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CTHP32929 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTHP32929 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTHP32929 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTHP32929 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CTHP32929 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTHP32929 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTHP32929 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTHP32929 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTHP32929 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTHP32929 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTHP32929 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTHP32929 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTHP32929 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTHP32929 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTHP32929 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTHP32929 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTHP32929 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTHP32929 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTHP32929 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CTHP32929 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTHP32929 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTHP32929 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTHP32929 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTHP32929 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTHP32929 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTHP32929 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTHP32929 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTHP32929 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTHP32929 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTHP32929 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTHP32929 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms