Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP2P32456 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP2P32456 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP2P32456 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP2P32456 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP2P32456 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP2P32456 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP2P32456 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP2P32456 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP2P32456 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP2P32456 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP2P32456 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP2P32456 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP2P32456 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP2P32456 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP2P32456 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP2P32456 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP2P32456 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP2P32456 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP2P32456 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP2P32456 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP2P32456 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP2P32456 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP2P32456 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP2P32456 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP2P32456 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP2P32456 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP2P32456 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP2P32456 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP2P32456 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP2P32456 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP2P32456 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP2P32456 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP2P32456 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP2P32456 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP2P32456 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP2P32456 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP2P32456 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP2P32456 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP2P32456 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP2P32456 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP2P32456 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP2P32456 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP2P32456 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP2P32456 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP2P32456 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP2P32456 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP2P32456 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP2P32456 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP2P32456 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP2P32456 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP2P32456 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP2P32456 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP2P32456 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GBP2P32456 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP2P32456 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP2P32456 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP2P32456 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP2P32456 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP2P32456 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP2P32456 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP2P32456 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP2P32456 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP2P32456 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP2P32456 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP2P32456 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP2P32456 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP2P32456 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP2P32456 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP2P32456 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP2P32456 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP2P32456 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP2P32456 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP2P32456 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP2P32456 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP2P32456 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP2P32456 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms