Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTX1P32242 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTX1P32242 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
OTX1P32242 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX1P32242 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX1P32242 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX1P32242 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX1P32242 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX1P32242 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX1P32242 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX1P32242 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX1P32242 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX1P32242 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX1P32242 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX1P32242 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX1P32242 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX1P32242 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX1P32242 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX1P32242 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX1P32242 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX1P32242 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX1P32242 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX1P32242 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX1P32242 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX1P32242 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX1P32242 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX1P32242 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX1P32242 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX1P32242 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX1P32242 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX1P32242 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX1P32242 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX1P32242 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX1P32242 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX1P32242 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX1P32242 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX1P32242 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX1P32242 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX1P32242 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX1P32242 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX1P32242 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX1P32242 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX1P32242 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX1P32242 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX1P32242 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX1P32242 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX1P32242 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX1P32242 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX1P32242 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX1P32242 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX1P32242 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX1P32242 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX1P32242 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX1P32242 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX1P32242 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX1P32242 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX1P32242 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX1P32242 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTX1P32242 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTX1P32242 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX1P32242 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX1P32242 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX1P32242 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX1P32242 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX1P32242 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX1P32242 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX1P32242 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX1P32242 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX1P32242 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX1P32242 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX1P32242 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX1P32242 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX1P32242 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX1P32242 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX1P32242 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX1P32242 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX1P32242 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX1P32242 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX1P32242 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX1P32242 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX1P32242 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX1P32242 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTX1P32242 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX1P32242 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX1P32242 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX1P32242 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX1P32242 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX1P32242 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX1P32242 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX1P32242 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX1P32242 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX1P32242 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX1P32242 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms