Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Notch4P31695 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Notch4P31695 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Notch4P31695 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Notch4P31695 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Notch4P31695 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Notch4P31695 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Notch4P31695 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Notch4P31695 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Notch4P31695 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Notch4P31695 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Notch4P31695 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Notch4P31695 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Notch4P31695 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Notch4P31695 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Notch4P31695 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Notch4P31695 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms