Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA7P31268 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA7P31268 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HOXA7P31268 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA7P31268 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA7P31268 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA7P31268 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms