Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tacr1P30548 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tacr1P30548 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tacr1P30548 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tacr1P30548 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms