Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LTKP29376 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LTKP29376 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LTKP29376 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LTKP29376 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LTKP29376 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LTKP29376 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LTKP29376 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LTKP29376 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
LTKP29376 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
LTKP29376 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LTKP29376 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LTKP29376 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LTKP29376 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LTKP29376 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LTKP29376 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LTKP29376 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LTKP29376 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
LTKP29376 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LTKP29376 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
LTKP29376 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LTKP29376 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LTKP29376 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LTKP29376 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LTKP29376 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LTKP29376 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LTKP29376 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LTKP29376 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
LTKP29376 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LTKP29376 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
LTKP29376 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LTKP29376 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LTKP29376 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LTKP29376 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LTKP29376 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LTKP29376 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LTKP29376 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LTKP29376 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
LTKP29376 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LTKP29376 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LTKP29376 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LTKP29376 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LTKP29376 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
LTKP29376 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LTKP29376 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LTKP29376 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
LTKP29376 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LTKP29376 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LTKP29376 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LTKP29376 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LTKP29376 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LTKP29376 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LTKP29376 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LTKP29376 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LTKP29376 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LTKP29376 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LTKP29376 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
LTKP29376 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LTKP29376 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LTKP29376 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LTKP29376 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LTKP29376 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LTKP29376 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
LTKP29376 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LTKP29376 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LTKP29376 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LTKP29376 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
LTKP29376 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LTKP29376 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LTKP29376 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LTKP29376 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LTKP29376 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LTKP29376 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LTKP29376 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LTKP29376 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LTKP29376 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LTKP29376 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LTKP29376 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LTKP29376 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LTKP29376 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LTKP29376 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
LTKP29376 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LTKP29376 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LTKP29376 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LTKP29376 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LTKP29376 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37■■■■□ 3.51
LTKP29376 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LTKP29376 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTKP29376 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTKP29376 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTKP29376 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTKP29376 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTKP29376 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms