Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTGFP29279 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTGFP29279 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTGFP29279 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTGFP29279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTGFP29279 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTGFP29279 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTGFP29279 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTGFP29279 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTGFP29279 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTGFP29279 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTGFP29279 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CTGFP29279 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTGFP29279 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTGFP29279 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTGFP29279 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTGFP29279 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTGFP29279 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTGFP29279 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTGFP29279 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTGFP29279 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTGFP29279 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTGFP29279 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTGFP29279 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTGFP29279 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTGFP29279 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CTGFP29279 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CTGFP29279 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTGFP29279 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTGFP29279 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CTGFP29279 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTGFP29279 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTGFP29279 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTGFP29279 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTGFP29279 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTGFP29279 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTGFP29279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTGFP29279 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTGFP29279 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTGFP29279 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CTGFP29279 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CTGFP29279 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTGFP29279 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CTGFP29279 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTGFP29279 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTGFP29279 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTGFP29279 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CTGFP29279 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTGFP29279 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTGFP29279 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTGFP29279 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTGFP29279 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTGFP29279 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTGFP29279 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTGFP29279 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTGFP29279 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CTGFP29279 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTGFP29279 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTGFP29279 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTGFP29279 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTGFP29279 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTGFP29279 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CTGFP29279 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTGFP29279 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTGFP29279 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTGFP29279 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CTGFP29279 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTGFP29279 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTGFP29279 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTGFP29279 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CTGFP29279 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTGFP29279 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTGFP29279 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTGFP29279 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CTGFP29279 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTGFP29279 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTGFP29279 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTGFP29279 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTGFP29279 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTGFP29279 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTGFP29279 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTGFP29279 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTGFP29279 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTGFP29279 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTGFP29279 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTGFP29279 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTGFP29279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTGFP29279 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CTGFP29279 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTGFP29279 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTGFP29279 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTGFP29279 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTGFP29279 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTGFP29279 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTGFP29279 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTGFP29279 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTGFP29279 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTGFP29279 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTGFP29279 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTGFP29279 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms