Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBL1P28749 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RBL1P28749 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBL1P28749 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBL1P28749 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBL1P28749 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBL1P28749 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBL1P28749 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBL1P28749 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBL1P28749 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBL1P28749 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBL1P28749 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBL1P28749 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBL1P28749 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RBL1P28749 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBL1P28749 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBL1P28749 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBL1P28749 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBL1P28749 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBL1P28749 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBL1P28749 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBL1P28749 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBL1P28749 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBL1P28749 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RBL1P28749 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBL1P28749 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBL1P28749 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RBL1P28749 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBL1P28749 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBL1P28749 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBL1P28749 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBL1P28749 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBL1P28749 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBL1P28749 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBL1P28749 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBL1P28749 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBL1P28749 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBL1P28749 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RBL1P28749 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBL1P28749 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBL1P28749 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBL1P28749 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBL1P28749 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBL1P28749 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBL1P28749 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBL1P28749 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBL1P28749 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBL1P28749 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RBL1P28749 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBL1P28749 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBL1P28749 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBL1P28749 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBL1P28749 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBL1P28749 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RBL1P28749 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBL1P28749 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBL1P28749 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBL1P28749 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBL1P28749 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBL1P28749 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBL1P28749 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBL1P28749 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBL1P28749 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBL1P28749 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBL1P28749 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBL1P28749 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBL1P28749 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBL1P28749 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RBL1P28749 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBL1P28749 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBL1P28749 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBL1P28749 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBL1P28749 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBL1P28749 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBL1P28749 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBL1P28749 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBL1P28749 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBL1P28749 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBL1P28749 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBL1P28749 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RBL1P28749 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBL1P28749 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBL1P28749 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBL1P28749 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RBL1P28749 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBL1P28749 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBL1P28749 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBL1P28749 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBL1P28749 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBL1P28749 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBL1P28749 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBL1P28749 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms