Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kif5cP28738 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif5cP28738 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif5cP28738 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif5cP28738 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms