Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa2P28309 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa2P28309 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa2P28309 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa2P28309 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa2P28309 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa2P28309 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa2P28309 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa2P28309 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa2P28309 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa2P28309 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa2P28309 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa2P28309 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa2P28309 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 491.3 ms