Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD27P26842 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD27P26842 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD27P26842 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD27P26842 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD27P26842 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD27P26842 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD27P26842 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD27P26842 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD27P26842 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD27P26842 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD27P26842 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CD27P26842 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD27P26842 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD27P26842 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD27P26842 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD27P26842 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD27P26842 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD27P26842 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD27P26842 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD27P26842 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD27P26842 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD27P26842 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD27P26842 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD27P26842 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD27P26842 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD27P26842 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CD27P26842 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD27P26842 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD27P26842 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD27P26842 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD27P26842 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD27P26842 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD27P26842 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD27P26842 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CD27P26842 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD27P26842 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD27P26842 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD27P26842 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD27P26842 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD27P26842 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD27P26842 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD27P26842 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD27P26842 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD27P26842 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD27P26842 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD27P26842 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD27P26842 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD27P26842 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CD27P26842 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD27P26842 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD27P26842 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD27P26842 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD27P26842 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD27P26842 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD27P26842 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD27P26842 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD27P26842 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD27P26842 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD27P26842 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD27P26842 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD27P26842 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD27P26842 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD27P26842 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD27P26842 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD27P26842 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD27P26842 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD27P26842 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD27P26842 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD27P26842 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD27P26842 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD27P26842 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD27P26842 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD27P26842 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CD27P26842 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD27P26842 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD27P26842 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD27P26842 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD27P26842 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD27P26842 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD27P26842 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CD27P26842 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD27P26842 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD27P26842 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD27P26842 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD27P26842 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CD27P26842 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD27P26842 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CD27P26842 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD27P26842 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD27P26842 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD27P26842 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD27P26842 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD27P26842 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD27P26842 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD27P26842 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD27P26842 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD27P26842 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD27P26842 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD27P26842 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms