Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Twist1P26687 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Twist1P26687 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Twist1P26687 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Twist1P26687 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Twist1P26687 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Twist1P26687 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Twist1P26687 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Twist1P26687 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Twist1P26687 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Twist1P26687 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms