Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 CHS7YHR142W 951 nt7.71□□□□□ -1.18
PTP1P25044 CSM2YIL132C 642 nt7.71□□□□□ -1.18
PTP1P25044 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.7□□□□□ -1.18
PTP1P25044 RRT14YIL127C 621 nt7.7□□□□□ -1.18
PTP1P25044 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.69□□□□□ -1.18
PTP1P25044 GGA2YHR108W 1758 nt7.69□□□□□ -1.18
PTP1P25044 MFT1YML062C 1179 nt7.68□□□□□ -1.18
PTP1P25044 ODC1YPL134C 933 nt7.68□□□□□ -1.18
PTP1P25044 YNL190WYNL190W 615 nt7.67□□□□□ -1.18
PTP1P25044 OLA1YBR025C 1185 nt7.67□□□□□ -1.18
PTP1P25044 BAP3YDR046C 1815 nt7.66□□□□□ -1.18
PTP1P25044 CAK1YFL029C 1107 nt7.66□□□□□ -1.18
PTP1P25044 OCH1YGL038C 1443 nt7.66□□□□□ -1.18
PTP1P25044 PET18YCR020C 648 nt7.65□□□□□ -1.18
PTP1P25044 DPL1YDR294C 1770 nt7.65□□□□□ -1.18
PTP1P25044 NDE1YMR145C 1683 nt7.65□□□□□ -1.18
PTP1P25044 GDH1YOR375C 1365 nt7.65□□□□□ -1.18
PTP1P25044 YPL247CYPL247C 1572 nt7.64□□□□□ -1.19
PTP1P25044 MAS1YLR163C 1389 nt7.64□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YPR084WYPR084W 1371 nt7.64□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.64□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.63□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.63□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.63□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YER156CYER156C 1017 nt7.63□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YIR035CYIR035C 765 nt7.63□□□□□ -1.19
PTP1P25044 MDM35YKL053C-A 261 nt7.63□□□□□ -1.19
PTP1P25044 MET22YOL064C 1074 nt7.63□□□□□ -1.19
PTP1P25044 ADA2YDR448W 1305 nt7.62□□□□□ -1.19
PTP1P25044 GPM1YKL152C 744 nt7.62□□□□□ -1.19
PTP1P25044 BEM1YBR200W 1656 nt7.62□□□□□ -1.19
PTP1P25044 THI3YDL080C 1830 nt7.62□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YDR467CYDR467C 327 nt7.61□□□□□ -1.19
PTP1P25044 KAE1YKR038C 1161 nt7.61□□□□□ -1.19
PTP1P25044 YBL095WYBL095W 813 nt7.61□□□□□ -1.19
PTP1P25044 PDC6YGR087C 1692 nt7.6□□□□□ -1.19
PTP1P25044 TAD2YJL035C 753 nt7.6□□□□□ -1.19
PTP1P25044 LAS17YOR181W 1902 nt7.58□□□□□ -1.2
PTP1P25044 FRT1YOR324C 1809 nt7.58□□□□□ -1.2
PTP1P25044 YPT31YER031C 672 nt7.58□□□□□ -1.2
PTP1P25044 GNP1YDR508C 1992 nt7.58□□□□□ -1.2
PTP1P25044 TMS1YDR105C 1422 nt7.58□□□□□ -1.2
PTP1P25044 INH1YDL181W 258 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 UTR5YEL035C 501 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.57□□□□□ -1.2
PTP1P25044 LEU4YNL104C 1860 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP1P25044 MIM1YOL026C 342 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP1P25044 RPS6AYPL090C 711 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP1P25044 AAC3YBR085W 924 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP1P25044 RPS6BYBR181C 711 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP1P25044 ELP4YPL101W 1371 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP1P25044 HXT10YFL011W 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
PTP1P25044 BUB2YMR055C 921 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP1P25044 BXI1YNL305C 894 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP1P25044 NBA1YOL070C 1506 nt7.55□□□□□ -1.2
PTP1P25044 YEL023CYEL023C 2049 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP1P25044 TDH1YJL052W 999 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP1P25044 MRS4YKR052C 915 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP1P25044 RNA170RNA170 169 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP1P25044 YMC2YBR104W 990 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP1P25044 YIL177CYIL177C 5277 nt7.53□□□□□ -1.2
PTP1P25044 CTF3YLR381W 2202 nt7.52□□□□□ -1.2
PTP1P25044 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP1P25044 YJR149WYJR149W 1215 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP1P25044 RHO1YPR165W 630 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP1P25044 CCR4YAL021C 2514 nt7.52□□□□□ -1.21
PTP1P25044 GGC1YDL198C 903 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP1P25044 YJL009WYJL009W 327 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP1P25044 PMA2YPL036W 2844 nt7.51□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 COS10YNR075W 1125 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 ATP2YJR121W 1536 nt7.5□□□□□ -1.21
PTP1P25044 ADE1YAR015W 921 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP1P25044 DUS3YLR401C 2007 nt7.49□□□□□ -1.21
PTP1P25044 NUP53YMR153W 1428 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP1P25044 PUP3YER094C 618 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP1P25044 YJL043WYJL043W 774 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP1P25044 PMU1YKL128C 888 nt7.47□□□□□ -1.21
PTP1P25044 FUS3YBL016W 1062 nt7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9 ms