Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCHP24723 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCHP24723 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCHP24723 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCHP24723 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCHP24723 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
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