Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxd11P23813 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxd11P23813 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxd11P23813 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxd11P23813 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxd11P23813 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxd11P23813 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxd11P23813 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms