Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPAP23025 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPAP23025 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPAP23025 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XPAP23025 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XPAP23025 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPAP23025 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XPAP23025 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPAP23025 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPAP23025 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPAP23025 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPAP23025 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPAP23025 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPAP23025 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPAP23025 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPAP23025 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPAP23025 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPAP23025 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPAP23025 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPAP23025 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPAP23025 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPAP23025 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPAP23025 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPAP23025 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPAP23025 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPAP23025 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPAP23025 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPAP23025 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPAP23025 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPAP23025 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPAP23025 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XPAP23025 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPAP23025 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
XPAP23025 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPAP23025 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
XPAP23025 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPAP23025 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XPAP23025 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPAP23025 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPAP23025 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XPAP23025 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPAP23025 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XPAP23025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPAP23025 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XPAP23025 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPAP23025 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XPAP23025 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
XPAP23025 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
XPAP23025 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPAP23025 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPAP23025 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPAP23025 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPAP23025 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XPAP23025 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPAP23025 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPAP23025 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPAP23025 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPAP23025 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPAP23025 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPAP23025 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPAP23025 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPAP23025 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPAP23025 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPAP23025 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPAP23025 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPAP23025 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPAP23025 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XPAP23025 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPAP23025 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPAP23025 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPAP23025 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPAP23025 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPAP23025 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XPAP23025 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPAP23025 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPAP23025 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPAP23025 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPAP23025 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPAP23025 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPAP23025 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPAP23025 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPAP23025 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPAP23025 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPAP23025 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPAP23025 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPAP23025 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPAP23025 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPAP23025 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPAP23025 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPAP23025 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPAP23025 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPAP23025 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms