Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL1P22362 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL1P22362 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL1P22362 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL1P22362 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL1P22362 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL1P22362 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL1P22362 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL1P22362 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL1P22362 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL1P22362 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL1P22362 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL1P22362 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL1P22362 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL1P22362 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL1P22362 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL1P22362 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL1P22362 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL1P22362 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL1P22362 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL1P22362 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL1P22362 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL1P22362 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL1P22362 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL1P22362 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL1P22362 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL1P22362 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL1P22362 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL1P22362 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL1P22362 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL1P22362 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL1P22362 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL1P22362 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL1P22362 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL1P22362 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL1P22362 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL1P22362 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL1P22362 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL1P22362 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL1P22362 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL1P22362 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL1P22362 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL1P22362 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL1P22362 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL1P22362 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL1P22362 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL1P22362 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL1P22362 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL1P22362 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL1P22362 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL1P22362 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL1P22362 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL1P22362 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL1P22362 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL1P22362 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL1P22362 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL1P22362 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL1P22362 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL1P22362 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL1P22362 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL1P22362 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL1P22362 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL1P22362 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL1P22362 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL1P22362 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL1P22362 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL1P22362 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL1P22362 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL1P22362 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL1P22362 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL1P22362 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL1P22362 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL1P22362 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL1P22362 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL1P22362 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL1P22362 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCL1P22362 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL1P22362 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL1P22362 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL1P22362 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL1P22362 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL1P22362 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL1P22362 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms