Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pou3f1P21952 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou3f1P21952 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou3f1P21952 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou3f1P21952 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou3f1P21952 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou3f1P21952 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms