Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCB4P21439 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCB4P21439 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCB4P21439 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCB4P21439 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB4P21439 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms