Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDK11BP21127 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK11BP21127 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK11BP21127 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK11BP21127 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms