Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tpm3P21107 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm3P21107 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm3P21107 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms