Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDCP20941 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDCP20941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDCP20941 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCP20941 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCP20941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCP20941 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCP20941 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCP20941 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDCP20941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDCP20941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDCP20941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PDCP20941 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDCP20941 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCP20941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCP20941 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCP20941 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCP20941 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCP20941 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDCP20941 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDCP20941 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDCP20941 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDCP20941 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDCP20941 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCP20941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCP20941 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCP20941 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCP20941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCP20941 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCP20941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCP20941 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCP20941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCP20941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PDCP20941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDCP20941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDCP20941 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCP20941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDCP20941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PDCP20941 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCP20941 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCP20941 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCP20941 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCP20941 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDCP20941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDCP20941 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCP20941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PDCP20941 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCP20941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCP20941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCP20941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDCP20941 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDCP20941 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCP20941 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCP20941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCP20941 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms