Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SDSP20132 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SDSP20132 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SDSP20132 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SDSP20132 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SDSP20132 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SDSP20132 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SDSP20132 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SDSP20132 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SDSP20132 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SDSP20132 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SDSP20132 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SDSP20132 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SDSP20132 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SDSP20132 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SDSP20132 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SDSP20132 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SDSP20132 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SDSP20132 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SDSP20132 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDSP20132 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDSP20132 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDSP20132 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDSP20132 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDSP20132 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDSP20132 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDSP20132 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SDSP20132 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SDSP20132 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SDSP20132 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SDSP20132 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SDSP20132 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SDSP20132 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SDSP20132 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDSP20132 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDSP20132 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDSP20132 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDSP20132 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SDSP20132 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SDSP20132 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SDSP20132 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SDSP20132 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SDSP20132 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SDSP20132 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SDSP20132 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SDSP20132 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SDSP20132 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SDSP20132 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SDSP20132 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDSP20132 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDSP20132 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDSP20132 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDSP20132 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDSP20132 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SDSP20132 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SDSP20132 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SDSP20132 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SDSP20132 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SDSP20132 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SDSP20132 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SDSP20132 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SDSP20132 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SDSP20132 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SDSP20132 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SDSP20132 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SDSP20132 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SDSP20132 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SDSP20132 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SDSP20132 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SDSP20132 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SDSP20132 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SDSP20132 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SDSP20132 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SDSP20132 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SDSP20132 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SDSP20132 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SDSP20132 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SDSP20132 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SDSP20132 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SDSP20132 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SDSP20132 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SDSP20132 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SDSP20132 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SDSP20132 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SDSP20132 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SDSP20132 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SDSP20132 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SDSP20132 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SDSP20132 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SDSP20132 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SDSP20132 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SDSP20132 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SDSP20132 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SDSP20132 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SDSP20132 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SDSP20132 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SDSP20132 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SDSP20132 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SDSP20132 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SDSP20132 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
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