Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox5bP19536 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox5bP19536 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cox5bP19536 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox5bP19536 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cox5bP19536 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cox5bP19536 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms