Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ms4a1P19437 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ms4a1P19437 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ms4a1P19437 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ms4a1P19437 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms