Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK1P19419 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK1P19419 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ELK1P19419 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK1P19419 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK1P19419 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELK1P19419 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK1P19419 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK1P19419 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ELK1P19419 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK1P19419 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK1P19419 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK1P19419 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK1P19419 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK1P19419 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK1P19419 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK1P19419 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK1P19419 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK1P19419 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK1P19419 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK1P19419 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK1P19419 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK1P19419 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK1P19419 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK1P19419 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK1P19419 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK1P19419 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK1P19419 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK1P19419 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK1P19419 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK1P19419 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK1P19419 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK1P19419 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK1P19419 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK1P19419 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK1P19419 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK1P19419 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK1P19419 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK1P19419 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK1P19419 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK1P19419 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK1P19419 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK1P19419 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK1P19419 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK1P19419 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK1P19419 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK1P19419 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK1P19419 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK1P19419 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK1P19419 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK1P19419 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK1P19419 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK1P19419 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK1P19419 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK1P19419 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK1P19419 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK1P19419 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK1P19419 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK1P19419 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK1P19419 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK1P19419 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK1P19419 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK1P19419 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK1P19419 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK1P19419 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK1P19419 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK1P19419 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK1P19419 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELK1P19419 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK1P19419 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELK1P19419 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK1P19419 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK1P19419 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELK1P19419 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK1P19419 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK1P19419 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK1P19419 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELK1P19419 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK1P19419 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK1P19419 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELK1P19419 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK1P19419 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK1P19419 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK1P19419 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK1P19419 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK1P19419 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELK1P19419 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK1P19419 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK1P19419 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK1P19419 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK1P19419 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELK1P19419 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms