Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2CP19387 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2CP19387 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2CP19387 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2CP19387 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2CP19387 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms